多伦多大学的研究职员发明,一类主要的DNA连系因子也能够连系RNA,并通过多种机制调理基因表达。这项研究揭晓在《分子细胞》期刊上,扩展了我们对这些卵白质功效的明确,并将其确立为一类新的RNA连系卵白。
C2H2锌指卵白是最大的DNA连系因子种别之一,主要加入转录历程,即将遗传信息从DNA复制到信使RNA(mRNA)。该家族包括700多个卵白质,大大都尚未获得深入研究。此前的研究主要关注它们在转录历程中的作用。
“我们研究了C2H2锌指卵白家族的150个成员,”该研究的第一作者、多伦多大学唐纳利细胞与生物分子研究中心的分子遗传学博士Syed Nabeel-Shah体现。“虽然这一类卵白质通常被以为是转录因子,但在我最先博士研究时,已经有少数卵白被发明也能连系RNA。我很好奇这种RNA连系能力是否是这些卵白质的普遍特征——效果证实确实云云。”
图片链接:https://www.eurekalert.org/multimedia/1045872
图片信息:博士结业生 Syed Nabeel-Shah 和大学教授 Jack Greenblatt。
“在我们研究的C2H2锌指卵白中,已有约莫120个卵白的DNA连系位点获得了确认,”Nabeel-Shah说道。他因这项研究获得了2024年唐纳利中心研究论文奖。“我们推测,若是这些卵白质也能连系RNA,那么它们在DNA和RNA上的连系位点可能会有所关联。但现实上并非云云,通常这些卵白质连系DNA的启动子区域和mRNA的三端非编码区。”
研究团队发明,C2H2锌指卵白可以调理多种后转录历程,对mRNA举行修饰,而mRNA是卵白质合成的模板。这些历程包括:通过剪接去除前体mRNA中的非编码区域、通过切割和加尾机制控制mRNA的长度,以及在转录后通过酶对mRNA举行m6A修饰。
在《基因组生物学》期刊揭晓的相关研究中,团队进一步探讨了特定锌指卵白怎样调理m6A修饰水平,基于他们在《分子细胞》中的最新发明。研究职员此前已经发明,一个被普遍研究的C2H2锌指转录因子——SP1,能够调理mRNA的替换切割和加尾。
“我们团队发明,C2H2锌指卵白的RNA连系能力仍是一个认知空缺,”该研究的首席研究员、唐纳利中心和Temerty院的分子遗传学教授Jack Greenblatt体现。“研究职员已往主要关注其DNA连系能力,但关于这些卵白质的RNA连系能力以及其在基因表达中的作用尚有许多未知。只管我们已经绘制了一些C2H2锌指卵白的RNA连系位点,但关于它们功效的深入研究才刚刚最先。”
这项研究是《分子细胞》RNA专题期刊中唯逐一篇来自加拿大的研究,提供了许多卵白质的RNA连系图谱,关于研究转录后调控原理的研究职员来说是名贵的资源。
杂志:Molecular Cell
DOI:10.1016/j.molcel.2024.08.037