辛辛那提儿童医院领衔的科研团队宣布了天下上最详尽的干细胞及早期前体细胞“图谱”,这些细胞加入了来自差别募捐者的人类血液的天生。
该团队识别出了80多种差别的造血干细胞及前体细胞(HSPCs)——这些早期细胞开启了成熟红细胞、白细胞及我们重大血液系统中其他因素的天生历程。这项研究效果于2024年3月21日揭晓于《Nature Immunology》杂志上。
整个研究团队包括四所学术医疗中心和两家生物手艺公司的26位合著者,他们在文中体现:“我们相信,针对最早期HSPCs、中心细胞状态以及基质群体,以及最常见的末梢状态接纳的高度专注的捕获战略,提供了迄今为止对骨髓干细胞和前体细胞区域最深入的视角。”
白血病研究和其他发明
这项重大的研究项目涉及使用多种先进的基因组研究工具和盘算要领,构建了来自差别种族和性别募捐者的凌驾30万个骨髓细胞的详细基因组和卵白质组剖面。辛辛那提儿童医院致力于在科学研究中提倡容纳性并解决生齿多样性问题,作为其一连使命的一部分。
除了准确的单细胞RNA测序事情和配套的流式细胞术,剖析重大的数据集还需要立异地使用机械学习手艺,并借助博弈论举行要害的统计剖析。团队使用的一些研究工具,包括两款在辛辛那提儿童医院开发的软件工具scTriangulate和pyInfinityFlow。
团队的主要发明包括:
·混淆了一种全新的“抗体产品”,包括132种可针对HSPCs及相关细胞的外貌卵白的抗体。
·测试批注,这种新混淆物在剖析人类骨髓细胞方面优于市售产品。
·通过融合基因表达和外貌卵白的立异要领,识别出89个细胞群集,展现了新的干细胞/前体细胞群体。
·疏散新细胞群体的战略和标记。首先,两种新的外貌标记物 C5L2 和 TSPAN33 用于识别进入祖细胞状态和成为成熟中性粒细胞之间的过渡状态的细胞。其次,具有CD326和CD235a的人类红细胞形成的差别分期,称为红细胞。
·新的在线盘算工具,用于展望急性髓系白血病 (AML) 等癌症的细胞起源和可能缘故原由。
人骨髓细胞状态的综合转录组图谱
虽然新的干细胞图谱的开发是一个主要的最先,但需要更多的研究和开发,将有关血细胞形成的新数据整合到医疗保健中。
用于骨髓祖细胞表征的优化抗体混淆物
虽然《自然免疫学》的文章已经开放获取,但完整的细节和对这一高级数字资源的会见,包括数据审查器、要领、原始数据和代码,可在 altanalyze.org/MarrowAtlas/ 上获得。
杂志:Nature Immunology
DOI:10.1038/s41590-024-01782-4